日本在抗日战争期间对云南的侵略主要涉及以下几个地区：
腾冲：
1942年5月10日，日军占领了腾冲。
龙陵：
1942年5月3日，日军占领了龙陵。
保山：
1942年5月5日，日军占领了保山。
芒市：
在抗战时期，芒市有一小部分被日军占领。
昆明：
1938年9月28日，日军首次轰炸昆明，之后频繁进行轰炸。
怒江地区：
日军从缅甸进入云南怒江地区，并在此地区进行了占领。
滇西其他城市：
除了上述地区，日军还轰炸了云南境内的其他多个城市，如蒙自等。
细菌战：
日军还对云南实施了细菌战，其中保山和昆明是主要目标。
这些侵略行为给当地民众带来了极大的痛苦和损失。云南由于战略位置重要，成为了抗日战争中的一个重要战场