微生物菌剂种类繁多，可以根据不同的分类方式进行划分。以下是几种主要的分类方式及微生物菌剂种类：
按内含的微生物种类或功能特性分类
根瘤菌菌剂
固氮菌菌剂
解磷类微生物菌剂
硅酸盐微生物菌剂
光合细菌菌剂
促生菌剂
菌根菌剂
生物修复菌剂
有机物料腐熟剂
按剂型分类
液体微生物菌剂
粉剂微生物菌剂
颗粒型微生物菌剂
按复合方式分类
单一微生物菌剂（一种微生物菌种制成）
复合微生物菌剂（两种或以上互不拮抗的微生物菌种制成）
按作用机理分类
根瘤菌类菌剂
固氮菌类菌剂
解磷菌类菌剂
解钾菌类菌剂
按应用领域分类
污水微生物菌剂（如硝化菌剂、反硝化菌剂、硝化反硝化复合菌剂、有机物强降解复合生物菌剂）
建议
在选择微生物菌剂时，应根据具体的应用需求、作物种类、土壤条件以及环境因素进行综合考虑，选择适合的菌剂种类和剂型，以达到最佳的应用效果。