汽车更换发动机需要办理的手续主要包括：
1. 准备材料：
车主的身份证原件及复印件（非当地户口需提供暂住证）。
更换发动机的证明材料。
发动机号码拓印件。
机动车登记证书和行驶证。
若发动机为免费更换，需提供4S店出具的免费更换证明。
若发动机为购买，需提供正规发票。
机动车变更登记申请表。
机动车安全技术检验合格证明。
2. 验车：
在车管所排队等待验车，工作人员会对车辆进行检查和审验。
3. 办理手续：
携带所有材料到车管所大厅，提交审核。
审核通过后，领取新的机动车行驶证和车辆登记证书。
4. 变更登记：
办理完毕后，及时查看机动车登记证书和行驶证上的车辆信息，确保信息准确无误。
5. 注意事项：
更换发动机后，车主必须在规定时间内（通常是10天内）向车管所提交更换申请。
变更发动机后，不得改变汽车的外形和主要技术参数。
遵守《机动车登记规定》等相关法规，否则可能面临违法处罚。
请根据这些步骤准备相应的材料，并按照规定程序办理更换发动机的手续。