侯君集谋反的原因是多方面的，主要包括以下几点：
直接原因
灭南昌国后被囚：侯君集因灭南昌国后贪财而被李世民下狱，出狱后心中不满，耿耿于怀，从而策划谋反。
与太子李承乾策划：侯君集与太子李承乾关系密切，李承乾因地位动摇而寻求侯君集的支持，侯君集认为跟随李承乾比辅佐唐太宗更有前途，于是加入其谋反集团。
间接原因
私心重：侯君集虽然位极人臣，但还想更进一步，独揽大权，这种私心驱使他走向谋反。
对朝廷不满：侯君集曾因为与宰相魏征的争执而被贬为庶人，这段经历可能让他对朝廷产生了强烈的反感情绪。
外部环境：唐朝初年政治局势动荡不安，各种势力纷争不断，侯君集作为一名战功显赫的将领，可能受到这种环境的影响，从而产生谋反之心。
其他因素
降服高昌后的行为：侯君集在降服高昌后，私自杀害百姓和私拿财宝，行为不端，被囚禁后心生怨望，这也是他谋反的一个重要原因。
李承乾的拉拢：太子李承乾因担心被废，多次请侯君集到东宫，并询问自保之策，侯君集认为李承乾愚昧低能，于是乘机利用他，参与其谋反计划。
综上所述，侯君集谋反的原因是多方面的，既有个人私心和不满，也有外部环境的影响，最终导致他走上了这条不归路。