公积金的扣款方式主要是由企业代扣代缴，具体操作步骤如下：
企业代扣代缴
企业在每个月的工资发放时，会在职工的工资中扣除相应的公积金缴纳金额。
企业将扣除的公积金金额和企业应缴纳的公积金金额一起汇总，然后通过银行转账等方式缴纳至公积金管理中心。
公积金管理中心收到企业的缴纳后，会将职工的个人公积金账户进行相应的记账操作，以便职工在需要时可以查询自己的公积金余额和缴纳情况。
公积金扣款计算
职工住房公积金月缴存额包括单位部分和个人扣款部分。
单位扣款部分以缴存基数乘以单位缴存比例计算，个人扣款部分以缴存基数乘以个人缴存比例计算。
单位和个人的缴存比例均不得低于缴存基数的5%，也不可以多于缴存基数的20%。
具体计算方法为：个人月缴存额 = 缴存基数 × 缴存比例（元以下四舍五入）；单位月缴存额 = 缴存基数 × 缴存比例（元以下四舍五入）；合计月缴存额 = 个人月缴存额 + 单位月缴存额。
扣款时间和方式
住房公积金的扣款时间一般为每个月的工资发放日，用人单位会在职工的工资中扣除相应的住房公积金缴存额度，并在规定的时间内将缴存的住房公积金款项汇入当地的公积金管理部门。
住房公积金的缴存方式一般为线上缴存或线下缴存，具体的缴存方式根据当地公积金管理部门的规定而定。
公积金提取
在特定情况下，职工可以提取住房公积金账户内的存储余额，例如购买、建造、翻建、大修自住住房，离休、退休，完全丧失劳动能力并与单位终止劳动关系，出境定居，偿还自住住房贷款本息，租房自住等。
公积金贷款扣款
公积金贷款的扣款流程包括：在还款卡里存入一个月的还款作为启动资金，到还款日，银行从公积金账户中提取出一个月的月还款，转入还款卡中，下个月再扣款。
建议：
职工应确保工资中代扣的公积金金额正确无误，并留意公积金管理中心的缴费通知，确保按时足额缴纳。
职工在需要提取公积金时，应提前了解当地公积金管理中心的具体提取条件和流程，并准备好所需材料。