八路军击毙赵侗的原因是因为赵侗接受了顽军委派，率领了200多名特务从西安返回晋察冀抗日根据地，配合石友三、鹿钟麟等人制造摩擦破坏活动。这些特务队潜入了灵寿县慈峪镇北霍营一带，公然制造袭击和破坏活动，残害无辜的抗日军民。八路军120师独1旅2团驰援过来，一举将特务队击溃，并将赵侗等人击毙。在战利品中，八路军还发现了顽军所谓的“委任状”和“行动计划”，确认了赵侗等人的罪行，从而粉碎了顽军破坏抗日根据地的阴谋。
此外，有资料显示，赵侗在1939年秋率300余人北上抗日，在河北新富、灵寿两县交界的陈庄附近遭到伏击战死，伏击者的身份一直不清楚。直到1949年，这一事件才被正式承认是由八路军120师独一旅第二团所为。
综合以上信息，八路军击毙赵侗是因为他率领特务队进行破坏活动，违反了抗日民族统一战线的原则，对抗日根据地造成了严重威胁。