99版5元人民币的版别主要包括以下几种：
黑9版：
背面1999年号中最后一个数字9呈现深紫色，紫得发黑。
红9版：
背面1999年号中最后一个数字9呈现鲜红色。
花9版：
背面1999年号中最后一个数字9左边紫色，右边红色拼接。
钻石伍：
币面中的“伍”字，第一个壁画中没有任何竖线。
绿云海：
币面上有环状的细小颗粒，在荧光灯下呈现类似云海的效果。
金口5：
在荧光灯下，纸币背面“5”字缺少封口。
9伍独尊：
同时具备黑9与钻石伍的特征。
阴阳9：
9字一半深一半浅。
花腰冠号：
包括F组、E组、G组、D组、H组的特定冠号，特征是背面年号中9字左右颜色不同。
白腰冠号：
包括Z组、P组、J组、I组、B组、C组的特定冠号，特征是背面年号中9字下方有白色条带。
荧光数字版：
纸币背面具有明显的绿色荧光，荧光强度越高，收藏价值通常也越高。
以上版别中，一些因具有特殊的颜色变化、图案特征或荧光效果而被认为是收藏市场上的珍品。每种版别都有其独特的辨识特征，对于收藏爱好者来说，了解这些特征有助于辨别和收藏。需要注意的是，上述信息基于历史数据和收藏市场的知识，实际情况可能会有所变化