魔方通常有六种颜色，这些颜色通常是红、黄、蓝、绿、白和橙。这些颜色在魔方的六个面上以特定的方式排列，以使得每一面都有一个独特的颜色，并且相对的两个面颜色相同。
魔方的配色方案有多种，但现今最流行的配色方案有两种：
国际标准配色 （也被称作“西方配色”或“BOY Color Scheme”）：
上：白色
下：黄色
前：绿色
后：蓝色
左：橙色
右：红色
日本配色
上：白色
下：蓝色
前：绿色
后：橙色
左：红色
右：黄色
最初的魔方配色方案与日本方案相似，但现代流行的配色方案有所变化，将一对相似色系的颜色安排在相对两边。
魔方的颜色不是随意选择的，而是基于CMYK的减色模式，通过在任一面中加入或减去黄色，可以得到它相对面的颜色