睡着时开指纹对方是否会醒来取决于几个因素：
睡眠深度：
如果对方处于深度睡眠状态，身体和神经系统都处于放松状态，可能不会醒来。
声音大小：
指纹解锁时产生的声音可能会被对方听到，如果声音较小，可能不会吵醒对方。
睡眠规律：
正常成年人的睡眠周期包括NREM（非快速眼动）和REM（快速眼动）阶段，其中REM阶段人最易醒来。如果指纹解锁发生在NREM阶段，对方可能会被吵醒。
个体差异：
不同人对声音的敏感度不同，有些人即使声音不大也可能被吵醒。
综上所述，睡着时开指纹对方可能会醒来，也可能不会，这取决于睡眠状态、声音大小以及个体差异。如果担心这个问题，可以在进行此类操作时尽量保持安静。