员工请假时工资的扣除方式主要依据事假和病假的性质以及公司的具体规定。以下是详细的扣除方法：
事假
无薪假：事假一般不带薪，员工因个人或家庭原因请的假期，用人单位可以不予支付工资。
按出勤比例扣除：如果员工请事假，可以按照当月实际出勤天数与应出勤天数的比例来扣除工资。例如，如果应出勤23天，但实际出勤20天，则实际应付工资为工资总额乘以20除以23。
病假
按比例扣除：病假期间，用人单位需支付病假工资，具体标准通常由公司自主确定，但不得低于当地最低工资标准的80%。
具体比例：
连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发。
连续工龄满2年不满4年的，按本人工资的70%计发。
连续工龄满4年不满6年的，按本人工资的80%计发。
连续工龄满6年不满8年的，按本人工资的90%计发。
连续工龄满8年及以上的，按本人工资的100%计发。
其他注意事项
最低工资标准：在计算病假工资时，必须确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准的80%。
公司规定：具体的请假工资扣除方法还需参照公司内部的薪资管理制度和劳动合同约定，但不得违反国家法律法规的强制性规定。
综上所述，员工请假时工资的扣除方式主要依据事假和病假的性质，事假通常无薪，病假则按一定比例扣除，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准的80%。具体扣除方法需结合公司规定和劳动合同进行确定。