当C1驾驶证被扣12分时，您需要按照以下步骤处理：
满分学习：
您需要在15天内到当地公安机关交通管理部门参加为期7天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
科目一考试：
完成学习后，您需要参加科目一考试。考试合格后，您的扣分将被清除，并且会发还您的机动车驾驶证。
注意事项：
如果您在一个记分周期内累积扣分达到12分，公安机关交通管理部门将扣留您的驾驶证，并通知您参加满分学习和考试。如果您拒不参加学习或考试，您的驾驶证可能会被公告停止使用。
请确保在规定的时间内完成上述步骤，以避免进一步的处罚。