摩托车被扣留后，车主应在规定期限内接受处理。通常情况下，机动车被扣留后，应当在15日内接受处理，否则可能面临强制报废。如果车主超过规定期限未处理，车辆将按照规定程序被吊销。在吊销前如果车主仍未处理完相关违章，车辆将被强制报废。不同地区和具体情况可能有细微差别，具体吊销时间还需参照当地规定。
需要注意的是，如果摩托车被交警扣留，车主应在15天以内带有效证件前往处理，超出时间会发函通知。如果超过三个月不去处理，并且无牌无证，则车辆可能会被拍卖等处理方式。
请根据具体情况，参照当地最新的交通管理规定，确定摩托车被扣后的处理时限和可能的报废处理。