南京市市旗的设计蕴含了丰富的象征意义，反映了南京深厚的历史和文化背景。以下是市旗设计的主要象征元素及其含义：
上部红色
象征太阳的光辉，代表光明和未来。
也象征烈士的鲜血，反映了南京今日的繁荣是烈士们牺牲换来的。
下部粉绿色
象征大地，代表生命力。
中间白线
象征长江，因为长江是南京文明的摇篮，也是历史的见证。
市徽中的辟邪
代表南京六朝古都的悠久历史。
辟邪的形象还展示了南京稳步向前，任何风浪都阻挡不了的未来。
市徽环围的飘带
上细下粗，代表奔腾不息的长江。
象征南京的建设如雄浑巨川，浩浩荡荡，势不可挡。
市徽下部的城堡
堡上有六垛女墙，代表南京六朝古都的身份。
整体而言，南京市市旗的设计旨在表达南京建立在绿色大地上，由先烈的牺牲而庄严地建立在长江边上的意象，凸显了这座城市的历史厚重感和未来发展的希望