生物钟，也称为生理钟，是生物体内的一种无形的“时钟”，它实际上是生物体生命活动的内在节律性，由生物体内的时间结构所决定。生物钟能够控制生物体内的时间、空间发生发展的质和量，影响包括生理、行为及形态结构等现象，并随时间作周期性的变化。例如，人体的体温、血压、脉搏等生理指标，以及体力、情绪、智力和月经周期等，都会随着昼夜变化而发生周期性变化。
生物钟对生物的健康有着巨大的影响，其紊乱可能导致生物容易生病、衰老或死亡。人体生物钟主要有以下特点：
1. 提示时间：生物钟能在特定时间提示需要完成的活动。
2. 提示事件：遇到特定事件时，生物钟能自动提示其他相关事件的发生。
3. 维持状态：生物钟能够帮助人们在进行某项活动时保持专注和持续。
4. 禁止功能：在需要休息或避免某些活动时，生物钟会发出信号。
生物钟受大脑的下丘脑“视交叉上核”（SCN）控制，与地球自转导致的昼夜节律相一致，影响睡眠、清醒和饮食行为等。研究生物钟在医学上有重要意义，并且对生物学的基础理论研究起着促进作用