不，新车折旧费通常不是由保险公司赔偿的。根据相关法律规定，保险公司在赔偿时通常只负责车辆损失和人身损害的直接费用，而不包括因事故导致的车辆贬值的间接费用，即折旧费。折旧费是车辆随着时间的推移和使用过程中自然因素的影响而发生的价值降低，属于车主应自行承担的费用。
如果车辆在事故中受损，保险公司会根据保险条款赔偿维修费用，但除非合同中有特别约定，否则不会赔偿折旧费。如果事故责任方不同意赔偿折旧费，受损方可能需要通过法律途径，如提起诉讼，来解决争议。
需要注意的是，虽然折旧费一般不在保险赔偿范围内，但在某些情况下，如追尾事故，如果可以证明车辆贬值损失是由事故直接引起的，且双方协商无果，法院可能会支持赔偿请求。