当党员档案丢失时，应采取以下步骤进行处理：
核实身份
确认党员身份的真实性，防止非党员冒用党员身份。
通过调查、函调等方式，由原单位或现单位党组织核实。
收集证明材料
收集能证明党员身份的相关材料，如入党志愿书、入党申请书、政审材料、教育考察材料等。
包括个人情况说明、入党介绍人证明、党支部负责人证明、支部和党委决议复印件等。
补办手续
现单位党组织在重新填写的入党志愿书相关栏目注明情况和原因，并提出承认党员资格的意见。
报上级党组织审核同意后，将补填材料存入本人档案。
补办入党志愿书
由现所在党支部负责补办，并在封面上注明补办原因并加盖公章。
补办人填写入党志愿书相关栏目，并确保内容真实反映入党时的状况。
存档
补办的材料连同原单位党组织的有关材料一并存入本人档案。
责任追究
确定责任归属，对相关责任人进行处理。
如发现非党员冒用党员身份，需一追到底，严肃处理。
请确保按照正式程序和要求进行补办，并由具有相应权限的党组织进行审核和批准。若有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告知