公司往来款的做账主要包括以下几个步骤：
记录发生的往来款
根据业务性质和往来单位或个人进行分类，记录在相应的会计科目下，如“应收账款”、“应付账款”、“其他应付款”等。
核对发票和收据
确保业务真实、合法，并核对金额、事项等信息的一致性。
确认债权债务关系
注意确认债权债务关系的正确性。
定期对账
与对方进行对账，发现和解决可能存在的差异和问题，确保记录的一致性。
编制会计报表
将所有往来款汇总并分类填列，以反映企业之间的债权债务关系和资金流动情况。
具体的会计分录示例：
采购时：
```
借：原材料（或其他相关科目）
应交税费——应交增值税——进项税
贷：应付账款
```
销售货物时：
```
借：应收账款（或其他相关科目）
贷：主营业务收入
应交税费——应交增值税——销项税
```
预先收到客户的货款：
```
借：银行存款（或其他相关科目）
贷：预收账款
```
支付给员工备用金：
```
借：其他应收款
贷：银行存款（或其他相关科目）
```
收到临时往来款：
```
借：银行存款（或其他相关科目）
贷：其他应付款
```
公司内部往来款（出借方）：
```
借：其他应收款——某某单位或个人
贷：银行存款等科目
```
公司内部往来款（借入方）：
```
借：银行存款等科目
贷：其他应付款——某某单位或个人
```
与总公司往来：
```
借：银行或现金
贷：其他应付
```
跟其他公司往来：
```
借：其他应收
贷：银行或现金
```
请注意，会计分录应根据实际情况进行调整，并遵循相关会计准则和法规。