医院科室承包通常是不合法的，具体依据如下：
1. 根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》第三十九条的规定，医疗卫生机构不得对外出租或承包医疗科室。
2. 《医疗机构管理条例》第二十三条也明确指出，《医疗机构执业许可证》不得出租、转让或出借。
3. 对于违反上述规定的行为，县级以上人民政府卫生健康主管部门有权责令改正，没收违法所得，并处以违法所得二倍以上十倍以下的罚款。
4. 私立医院虽然以盈利为主，但依然需要遵守相关法律规定，不得进行科室承包。
需要注意的是，以上信息基于我知识截止日期前的法规，法律法规可能会有更新，具体情况应咨询当地卫生健康主管部门或法律专业人士