果郡王确实知道弘曕和灵犀是他的孩子。尽管在《甄嬛传》这部剧中，并没有直接的场景显示果郡王得知真相，但通过一系列的细节和行动，可以推断出他早已知晓自己与甄嬛的孩子关系。
果郡王对弘曕和灵犀的慈爱：
在剧中，果郡王对弘曕和灵犀的眼神充满了父爱，这无法用常理解释，除非他知晓他们是自己的子女。
甄嬛的暗示：
甄嬛在提及孩子时，曾暗示如果孩子被指认为果郡王，她可能会疯掉，这进一步印证了孩子与果郡王之间的关联。
果郡王的保护行为：
果郡王在知道甄嬛怀孕后，选择不公开真相，并保护甄嬛和孩子的安全，这从他的行为和决策中可以明显看出。
剧中其他角色的行为：
剧中其他角色的一些异常行为，比如舒太妃对果郡王突然燃起希望的反应，也间接表明了果郡王知晓真相的可能性。
演员的失误：
在现实中，有说法称果郡王的死是一场演员的失误，暗示了剧情中可能存在的错误，但这一说法并不影响剧情的解读。
综上所述，通过剧情中的细节和角色行为，我们可以合理推断，果郡王知道弘曕和灵犀是他的孩子，并且为了保护他们，选择了沉默和保护。