朱允炆没有杀朱棣的原因主要有以下几点：
性格原因：
朱允炆性格温和，宽厚仁慈，受儒家教育影响，重视仁义道德，不愿意做出诛杀叔叔这样的事。
政治考量：
直接针对朱棣可能会引起其他藩王的反抗，特别是考虑到朱棣的实力和与其他藩王，尤其是周王朱橚的紧密关系。
集团力量：
朱棣背后有一个强大的集团支持，即便杀掉了朱棣，集团也可能选出新的代理人，对朱允炆的统治构成威胁。
事件巧合：
在朱允炆有机会对朱棣采取行动之前，皇宫起火，朱允炆下落不明，这使得他失去了直接对抗朱棣的机会。
朱棣的行动：
朱棣也不会坐以待毙，他通过发动靖难之役来对抗朱允炆，最终成功夺取了皇位。
以上几点综合反映了当时的政治局势和朱允炆的个人性格及处境