科目二缺考的后果主要包括以下几点：
判定为不合格：
如果考生预约了科目二考试但未参加，将会被判定为不合格。
需缴纳补考费：
科目二缺考后，考生需要重新预约补考，并需缴纳补考费用。
浪费考试机会：
科目二考试一共有五次机会，缺考意味着浪费了一次宝贵的考试机会。
需重新预约：
缺考后，考生需要重新预约补考，且重新预约可能需要等待一段时间。
影响其他科目成绩：
如果考生因缺考导致科目二不合格，那么之前通过的其他科目成绩也将作废，需要重新参加考试。
可能面临额外手续：
在某些情况下，缺考后可能还需要到车管所进行面签等手续。
因此，建议考生务必珍惜每一次考试机会，按时参加考试，避免因缺考带来不必要的麻烦和损失。如果因故不能参加考试，应提前申请取消预约，以免被判定为不合格。