迈克尔·乔丹的巅峰时期通常被认为是1988年和1989年。在这两年中，他不仅带领芝加哥公牛队赢得了NBA总冠军，而且在个人表现上也达到了顶峰，场均得分分别达到了惊人的35分和30.2分，并且在这两年中乔丹还获得了NBA最有价值球员（MVP）奖项。
1988年，乔丹场均得到35分，季后赛更是有场均36.3分7.1篮板4.7助攻2.4抢断1.1封盖的出色数据。这一年，他赢得了得分王、MVP和最佳阵容等荣誉，并带领公牛队夺冠，成为了无可争议的篮球之神。
1989年，乔丹开始转型助攻王，并在那个赛季完成了个人职业生涯的30次三双，其中16次发生在这个赛季。
因此，根据这些数据和成就，可以认为1988年和1989年是迈克尔·乔丹职业生涯的巅峰时期