建曲和神曲在中医中属于不同的药物类别，它们具有不同的药用价值和治疗范围。以下是它们的主要区别：
成分不同
神曲通常由辣蓼、青蒿、杏仁泥、赤小豆、鲜苍耳草加入面粉或麸皮后发酵而成。
建曲则是由建曲（可能是指建神曲）和其他如防风、羌活、厚朴、白术等40多种药物混合发酵而成。
功效不同
神曲具有消食和胃的作用，适用于消化不良、食欲不振等症状。
建曲具有理气化湿、健脾消食、解表的功效，适用于腹煮吐泻、痢疾、感冒头痛等症状。
适应症不同
神曲主要用于治疗饮食积滞、消化不良、腹胀腹痛等。
建曲除了能治疗饮食积滞外，还能治疗暑湿泄泻、呕吐等症状。
尽管建曲和神曲都是发酵的中成药，并且可能在某些情况下可以互相替代，但它们在成分、功效和适应症上有明显的区别。患者在选择药物时应根据自身病情和医生的建议进行。