CAJ和PDF各有其优缺点，具体哪个更好取决于用户的需求和使用场景。以下是它们之间的一些比较：
格式特性
CAJ：
是中国知网特有的一种文件格式，占用空间小，通常需要专门的CAJ阅读器（如CAJViewer）来阅读。
具有大纲链接，方便文献的阅读和快速定位。
通常包含丰富的格式和排版信息，但打印效果可能不如PDF清晰。
PDF：
是一种通用的电子文档格式，可以在多个设备上直接查看，显示效果较好。
不需要专门的阅读器，使用广泛，相关的阅读和编辑工具也更多。
通用性和兼容性
CAJ：
由于需要专门的阅读器，其通用性相对较低，不便于在没有CAJ阅读器的设备上查看。
转换为PDF后，可以增加文件的通用性和便捷性，方便分享和阅读。
PDF：
可以使用各种通用的PDF阅读器打开，具有很高的通用性。
可以轻松转换为其他格式，如Word，便于编辑和修改。
编辑和批注
CAJ：
支持批注和修改，但相比PDF，其编辑功能较为有限。
可以通过CAJ转PDF工具转换为PDF，从而利用PDF的编辑功能。
PDF：
支持批注、修改和转换等多种编辑功能，且转换后的文件稳定性较高。
适用场景
CAJ：
适合需要在中国知网平台内阅读和编辑的学术性资料，如期刊、论文等。
如果经常需要在中国知网进行学术研究和阅读，CAJ格式可能更为方便。
PDF：
适合需要广泛分享和查看的电子文档，如学术论文、报告等。
如果需要将文档用于编辑、打印或分享给没有CAJ阅读器的设备，PDF格式更为适用。
建议
如果你主要在中国知网进行学术研究和阅读，且需要频繁编辑和批注文档，可以考虑使用CAJ格式。
如果你需要将文档用于广泛分享和查看，或者需要将其转换为其他格式（如Word），建议使用PDF格式。
无论选择哪种格式，都可以利用现有的转换工具（如CAJ转PDF）来满足不同的需求。