碗莲在第二年的处理方式主要包括以下几点：
翻盆换土
经过一年的生长，碗莲的盆底淤泥需要更换，养分消耗也差不多，翻盆有利于植株生长。
取出藕时注意不要伤害藕芽，清除颜色较深的旧藕，然后换上新土壤，重新栽种藕根。
适当施肥
开花后适当施肥，但不宜过多，建议使用少量有机肥。
避免使用浓肥或生肥，以免烧伤根系。
光照管理
碗莲开花后适当晒太阳，但光照不宜过强，散光照射即可。
保护种籽
如果碗莲结出莲蓬并结出种籽，需要重点保护，避免被风吹走或被虫子吃掉。
过冬保护
碗莲是多年生水生植物，入冬后水下的根茎仍然存活，室内盆栽也可以安全过冬，只要水温不低于0℃。
观赏性维护
定期修剪碗莲的枝叶，以增加植株的观赏性。
以上步骤可以帮助碗莲在第二年健康生长，并有可能再次开花。