初中借读生的学籍处理方式如下：
开具转学证明
首先，需要到户籍所在地所属校区的学校开具转学证明，一般由学校校长出具并加盖公章，以备后续使用。
转入地学校办理入学证明
接着，到转入地的学校（通常是市教育局）相关部门办理入学证明，带上各类证明和转学证明。
报名入学
然后，将剩余的一份转学证明和市教育局的入学证明带到所在地区的学校报名即可。
电子学籍转移
原先的学校会要求填写电子学籍，填写完毕后，原先的学校会将电子学籍发给转入的学校。
学籍保留与管理
借读生的学籍仍然保留在原学校，由学籍注册学校负责管理和建立学籍档案、学生发展报告和高考电子档案。借读校无法为借读生重新建立学籍，但需为借读生提供学习成绩和表现评语等信息。
借读手续
学生或监护人需向在读学校提出书面借读申请，出具相关证明材料，并提供接收学校同意借读的证明。学校审核后出具借读证明，并由教育主管部门盖章备案。借读学生的学籍保留在原校，借读学校需记录借读期间的学习成绩和表现。
总结：
初中借读生的学籍主要保留在原学校，通过开具转学证明和入学证明等手续，将学籍转移到转入学校。借读生仍需在原学校保留学籍，并且借读学校需为借读生提供必要的学习成绩和表现评语。建议提前了解并准备好所有相关手续，确保借读过程顺利。