在《西游记》中，真假美猴王的故事里，死掉的是六耳猕猴。以下是一些支持这一观点的理由：
称呼区分：
原著中在描述真假美猴王时，使用了不同的称呼来区分两者，真行者被称为“这大圣”或“孙大圣”，而假行者被称为“那行者”或者“那怪”。
自我揭露：
在如来佛祖面前，六耳猕猴自己跳出来揭露了自己的真实身份。
唐僧的反应：
经历了真假美猴王事件后，唐僧再也没有对孙悟空念过紧箍咒，并且对孙悟空的态度有了改变，更加信任和听从孙悟空，这表明死掉的并非孙悟空。
原著情节：
原著第五十七回详细描述了真假美猴王的故事情节，指出六耳猕猴被如来佛祖制住，孙悟空一棒子打死了他。
角色定位：
六耳猕猴作为四大灵猴之一，其死与孙悟空的心性和佛道斗争有关，而孙悟空作为主要角色，其性格的转变和成长是故事的重要部分。
因此，根据以上分析，可以得出结论，在《西游记》的真假美猴王故事中，死掉的是六耳猕猴