在《口袋妖怪超级绿宝石》中，获取水之石的方法有：
在气象中心东南边的河岸上可以找到水之石。
使用绿碎片在超能力道馆城市周围的一个屋子进行交换。
3. 如果你是游戏版本386，可以在日川市（打鸟道馆的城市）的商店里用2100元购买水之石。
在双鹿市周围海域可以捡到蓝色碎片，然后在超能力道观城镇左边的屋子用水之石碎片进行交换。
废弃船中也有机会找到水之石，其中一个房间可以通过潜水进入另一个地方。
在卡依市下方水域的左侧有一个船，那里也有水之石。
在道谷市旁边的一个屋子里可以用蓝色碎片换取水之石。
请根据你的游戏版本和进度选择合适的方法来获取水之石。