关于火影忍者中主角漩涡鸣人为什么不跟父亲姓的问题，根据提供的信息，可以整理出以下几个可能的原因：
漩涡一族的名望
漩涡一族在木叶村的名望很高，初代目火影的夫人就是出身于此族。
漩涡一族在战国时代有封印尾兽的重要使命，鸣人作为漩涡一族的后代，姓漩涡是合理的。
保护鸣人安全
鸣人出生时，九尾袭击了木叶村，为了保护鸣人的安全，四代火影波风水门选择让鸣人随母亲姓。
如果鸣人姓波风，可能会成为面具男（宇智波斑）的目标，从而陷入危险。
避免特殊待遇
四代火影不希望鸣人因为父亲的身份而受到特殊待遇，希望他能够自立自强。
隐藏九尾妖的存在，防止九尾被释放给木叶村带来危险。
家族使命与责任
漩涡一族有将九尾封印在族人身上的使命，鸣人最终成为了人柱力，完成了漩涡一族的重托。
避免逻辑问题
岸本为了保持故事设定的连贯性，避免因设定不一致而产生的逻辑问题，选择让鸣人随母姓。
文化传统
虽然日本传统中孩子通常跟父亲姓，但存在特殊情况，如孩子随母亲姓，这在现实中也是存在的。
综合以上信息，可以得出结论，鸣人选择跟母亲姓是出于多方面的考虑，包括保护鸣人安全、避免特殊待遇、完成家族使命以及保持故事设定的逻辑性。这些原因共同作用，使得鸣人姓漩涡成为了一个合理的选择