复旦大学医学院和上海交通大学医学院都是国内顶尖的医学院校，各有其特色和优势。选择哪一所更好，取决于您的个人兴趣、专业方向以及未来的职业规划。以下是两所医学院校的一些比较：
复旦大学医学院
基础医学：复旦大学的基础医学在国内有很高的声誉，曾经排在全国第一，合并后虽然有所变动，但依然保持较高水平。
药学：复旦大学和上海第一医科大学（上医大）的药学领域一直是中国顶尖的，复旦的药学院是国内最具影响力的药学院校之一。
附属医院：复旦大学拥有中山和华山两家高质量的附属医院，提供良好的临床教学环境。
上海交通大学医学院
临床医学：交大的临床专业非常强，有“六星级”临床专业的称号，并且附属医院数量多，包括知名的瑞金医院等。
口腔医学：交大的口腔医学专业也非常出色，就业率高达100%。
国际化：交大医学院在国际化方面做得较好，例如开设了法语班的临床医学八年制，这在国内外都是较为罕见的。
综合比较
科研与教学：两校在科研和教学质量上都非常出色，各有侧重。复旦在基础医学研究方面较强，而交大的临床和口腔医学更为突出。
就业前景：两所院校的毕业生就业前景都很好，但交大的临床和口腔医学专业就业率相对更高。
结论
选择哪一所医学院校，您应该根据自己的兴趣和职业规划来决定。如果您对基础医学研究感兴趣，或者希望在上海这个国际化大都市接受教育，复旦大学医学院可能更适合您。如果您更倾向于临床和口腔医学专业，或者希望接受更加国际化的医学教育，上海交通大学医学院可能是更好的选择。
希望这些信息对您有所帮助，