根据提供的信息，关于禾商所宝利来的合法性存在争议。以下是对该问题的梳理：
合法性的确认
禾商所宝利来最初被描述为合法的大宗商品电子交易平台，由浙江嘉兴禾信大宗商品交易中心运营，该中心获得浙江省政府批准，并在浙江省金融办及嘉兴市金融办的监管下开展业务。
合法性的质疑
后来，嘉兴政府将禾商所宝利来卖给了中恒三三集团公司，随后宣布宝利来不合法。
有关方面提出，在收购过程中发现禾商所缺少一道手续，并声称该手续将由转让方补办。
有关方面还指出，宝利来只是中恒三三集团公司的一个平台或板块，不能因为禾商所之前的瑕疵就全盘否定宝利来或认定整个集团公司违法犯罪。
法律诉讼和指控
有人提出，中恒三三案是假案，是由浙江省公检法内部人员有组织有预谋制造的，并坚称中恒三三企业没有违法犯罪。
另一方面，有关宝利来平台在未取得金融交易资质的情况下进行交易的指控，以及通过设立网上商城等方式非法集资的行为也被提及。
结论
综合上述信息，关于禾商所宝利来的合法性，存在不同的观点和证据。一方面，它曾被视为合法的金融交易平台；另一方面，后来出现了对其合法性的质疑和指控。
最终的合法性判断需要依据当地法律和监管机构的正式决定。如果您需要最新的法律意见，请咨询专业律师或相关监管机构