自建厂房需要交纳的税种主要包括：
房产税：
自建成之次月起征收，按照房产原值计算缴纳，包含地价、开发土地成本费用等。
城镇土地使用税：
占用土地的单位和个人应缴纳，基于土地面积和所在地区的税率标准计算。
印花税：
在合同交易过程中缴纳，包括购买土地和建设厂房的相关合同。
增值税：
自建过程中涉及不动产和应税劳务的销售，会产生增值税。
城市维护建设税和教育费附加：
根据增值税额的一定比例缴纳。
土地增值税：
转让厂房收入减去扣除项目后的增值额，按超率累进税率计算缴纳。
企业所得税：
企业应就其生产、经营所得和其他所得计算缴纳企业所得税，出售厂房收入属于财产转让收入，应并入收入总额计算缴纳。
请注意，税法规定可能会有更新，具体情况建议咨询当地税务机关或专业税务顾问