苹果日版和国行iPhone的主要区别包括：
语言和系统
日版通常预装日语系统，界面和内置应用主要面向日本市场。
国行版预装中文系统，更适合中国用户使用。
保修和售后
国行版在中国享有官方保修服务，维修和售后相对方便。
日版iPhone的保修服务通常只限于日本，若带到中国可能需要额外的国际保修协议。
价格和税
国行版在中国市场销售，价格通常受到税务影响，相对便宜。
日版由于关税问题，价格可能会较高。
串码和IMEI
国行版更容易解锁，适合需要在中国市场解锁的iPhone用户。
3C认证
国行版通常符合中国的3C认证标准，而日版可能不符合。
版本类型
日版分为有锁版和无锁版，有锁版无法在中国正常使用，无锁版则和国行相差不大。
拍照声音
日版iPhone在拍照时默认开启声音，且音量最大，无法关闭。
充电行为
国行版iPhone关机充电直到充满都不会有问题，日版充电到一定程度就会自动开机。
网络兼容性
国行版支持中国的所有通信网络，即全网通。
日版根据是否有锁，可能只支持部分网络制式。
选择国行版更符合大部分中国用户的实际需求和便利性，而日版适合对系统定制有特殊需求或者不介意维修成本较高的用户