工程印花税的税率如下：
建筑工程勘察、设计合同以及建筑、安装工程承包合同：
印花税税率为0.03%。
加工承揽合同：
印花税税率为0.05%。
其他合同：
如借款合同、产权转移书据、营业账簿中记载资金的账簿等，具体税率根据不同类型分别为0.05‰、0.3‰、0.5‰、1‰、4‰。
因此，工程合同的印花税税率主要根据合同类型来确定，建筑工程相关合同的印花税税率为0.03%，而加工承揽合同的印花税税率为0.05%。其他类型的合同如借款合同、产权转移书据等则适用不同的比例税率。
建议在实际操作中，根据具体合同类型查阅最新的税法规定，以确保准确计算和缴纳印花税。