马云通过多种方式赚钱，主要包括以下几个方面：
广告位收入
淘宝平台通过提供广告位赚取广告费，商家为了提高曝光率愿意支付广告费用。
软件技术费用
淘宝后台提供的小工具软件，如数据分析工具，帮助商家分析销售情况，需支付费用。
入驻费用
天猫平台要求商家入驻并支付维护费，虽然费用在商家离开时退还，但期间由平台保管。
利息费
支付宝提供借贷服务，如借呗，用户借款需支付利息，这是支付宝的重要收入来源。
数据分析和信用认证服务
阿里巴巴提供信用认证服务，帮助商家建立信用，同时收集企业需求信息，赚取服务费。
交易手续费
商家在淘宝以外的平台使用支付宝进行交易时，需要向支付宝支付交易手续费。
投资和收购
马云通过投资或收购其他公司，利用这些公司的盈利为阿里巴巴带来额外收入。
电子商务搜索服务
阿里巴巴推出电子商务搜索服务，通过提供搜索结果和相关服务赚取收入。
其他服务
阿里巴巴还提供包括物流、支付等在内的多种电子商务相关服务，通过这些服务赚取收入。
这些盈利模式共同构成了阿里巴巴复杂的盈利体系，使其在互联网行业中具有独特的竞争优势。