自营店和旗舰店都提供正品商品，但它们在经营模式、商品来源、物流和售后等方面存在一些差异。以下是它们之间的一些比较：
经营模式
自营店：通常是企业直接经营的零售店，商品由企业自己采购并销售给消费者。
旗舰店：是品牌在某城市中最大且最为丰富齐全的营业店，或拥有最快上市速度等特点的专门店或专营店。旗舰店可以是品牌自己经营，也可以是品牌授权给第三方经营。
商品来源
自营店：商品由企业直接从供应商处采购，并自己负责库存和物流。
旗舰店：商品由品牌方直接提供给店铺，或通过品牌授权的第三方经销商提供。
物流和售后
自营店：通常使用自己的物流系统，配送速度和售后服务相对较好，因为企业直接管理这些环节。
旗舰店：物流通常由品牌方或第三方物流提供，售后服务的质量可能因店铺而异，品牌方通常会对旗舰店有较高的管理要求。
信誉和可靠性
自营店：因为直接由企业运营，且有严格的监管，所以信誉较高，商品质量相对有保障。
旗舰店：代表品牌形象和信誉，品牌方通常会严格管理，但也不能完全避免假货问题，尤其是非官方授权的旗舰店。
建议
如果追求正品保障和物流速度，京东自营店和天猫官方旗舰店都是不错的选择。京东自营店在数码产品方面表现尤为出色，物流速度快，售后服务好；天猫旗舰店则品牌众多，商品种类丰富。
如果注重价格和独家款式，可以考虑选择旗舰店，尤其是品牌直接运营的店铺，但要注意查看店铺授权信息，确保真实性。
无论选择哪种渠道，都要仔细查看商品详情和售后政策，确保购物体验和权益。
综合来看，自营店和旗舰店都可以提供正品商品，但各有其优势。消费者可以根据自己的需求和偏好选择合适的购物渠道。