荧光染料是一类能够吸收特定波长的光并发出较长波长荧光的化合物，广泛应用于生物学、医学和材料科学等领域。以下是一些常见的荧光染料分类及其例子：
荧光有机染料
有机小分子染料：如FITC（异硫氰酸荧光素）、PE（藻红蛋白）、PerCP（多甲藻黄素叶绿素蛋白）、PI（碘化丙啶）、APC（别藻青蛋白）、Cy3、Cy5、Alexa Fluor 488等。
核酸染料：用于细胞核染色，如DAPI、Hoechst 33342、噻唑橙、吖啶橙等。
高分子聚合物：用于细胞内染色和磷酸化染色。
油溶性荧光染料：如尼罗红、BODIPY系列染料、荧光素衍生物、罗丹明系列染料、四苯乙烯衍生物、香豆素衍生物等。
荧光蛋白
如绿色荧光蛋白（GFP）及其变体，广泛应用于生物学研究中的细胞成像和蛋白质追踪。
量子点
纳米级半导体材料，大小可调以调控发射光的波长，用于生物成像和LED显示器等领域。
金属络合物
通常具有较高的荧光量子产率和较长的寿命。
复合荧光染料
利用荧光共振能量转移技术合成的，由供体和受体荧光物分子组成，用于科研和临床应用的荧光染料。
荧光染料的选择取决于所需的荧光颜色、稳定性、与目标分子的结合能力以及光漂白速率等因素。它们可以单独使用，也可以组合成复合染料使用，以适应不同的实验需求