火麒麟在《风云》这部作品中流泪的原因可以归纳为以下几点：
同类认同
聂风体内有麒麟血，使得火麒麟将其视为同类。
使命未完成
火麒麟守护神州龙脉，聂风要杀它意味着龙脉可能受到威胁，火麒麟为此感到悲伤。
恩情难忘
聂风曾因救火麒麟而得到其救命之恩，火麒麟对聂风有感情，不忍心伤害。
命运无奈
火麒麟感受到自己和聂风都受制于命运，对即将到来的悲剧感到无奈和悲伤。
守护者的后代
火麒麟原本不认识守护者的后代，直到临死前才发现自己杀了守护者的后代，并为此感到悔恨。
情感纠葛
火麒麟与聂风之间有着深厚的友情，即使聂风入魔，火麒麟对其仍有感情，不忍心下手。
无法反抗
火麒麟可能因为聂风体内血液的变化，感到无力反抗，只能眼睁睁看着悲剧发生。
以上几点综合起来，可以解释为什么火麒麟在临死前会流泪。它不仅仅是因为悲伤和无奈，还因为与聂风之间复杂的情感纠葛和对命运的不甘。