《超凡蜘蛛侠3》未能拍摄的原因主要有以下几点：
角色年龄问题：
主演安德鲁·加菲尔德的年龄已经不符合蜘蛛侠年轻形象的要求，漫威希望角色保持年轻活力，因此需要寻找新的演员来重启这一系列。
漫威与索尼的共享协议：
漫威希望共享蜘蛛侠这个角色，而索尼希望保留对蜘蛛侠的版权，这导致了双方在拍摄计划上的分歧和延误。
票房未达预期：
前两部《超凡蜘蛛侠》电影的累计票房并未达到索尼影业的预期目标，这可能使得索尼对继续投资该系列产生了疑虑。
导演与演员的矛盾：
导演马克·韦伯不愿意继续执导《超凡蜘蛛侠3》，并且与主演安德鲁·加菲尔德的关系不佳，这也影响了电影的拍摄进程。
内部决策变动：
索尼影业内部出现分裂，新的领导层对蜘蛛侠这个超级IP的理解不同，最终决定放弃自行拍摄，转而与漫威合作。
综合以上因素，可以得出结论：《超凡蜘蛛侠3》未能拍摄主要是因为角色年龄、漫威与索尼的共享协议、票房未达预期、导演与演员的矛盾以及内部决策变动等多方面的原因。