细菌合成代谢产物主要包括以下几类：
热原质：
革兰阴性菌合成的菌体脂多糖，注入人体或动物体内能引起发热反应。
毒素和侵袭性酶：
细菌产生的毒素，包括内毒素和外毒素。内毒素是革兰阴性菌的脂多糖，外毒素是革兰阳性菌产生的蛋白质，具有毒性。
色素：
包括水溶性色素（如铜绿假单胞菌的色素）和脂溶性色素（如金黄色葡萄球菌的色素），不同细菌产生不同的色素，在细菌鉴别上有意义。
抗生素：
如青霉素、链霉素等，能够抑制或杀死其他微生物，是细菌在自然竞争中产生的一类重要有机化合物。
细菌素：
某些细菌产生的具有抗菌作用的蛋白质，通常对同种或近缘种细菌具有抑制作用。
维生素：
细菌合成的一些维生素，对细菌生长和代谢是必需的。
这些合成代谢产物在细菌的生存和与其他生物的相互作用中起着重要作用