福临皇帝的皇后有两位，分别是：
孝庄文皇后：
她是福临的母亲，博尔济吉特氏，在福临继位后成为皇后，并辅佐三朝，以政治家的才能和谋略帮助其夫皇太极，广纳人才，并帮助幼子福临继承大统。
孝惠章皇后：
她是福临的第二任皇后，孝庄太后的侄孙女，与福临结婚后成为皇后，并在福临去世后受到康熙帝的尊崇。
福临的第一任皇后是博尔济吉特氏，但不幸的是，她在婚后并不受宠，而且福临与摄政王多尔衮关系紧张，导致这段婚姻并不幸福。福临对孝庄文皇后的侄女博尔济吉特·孟古青的皇后之位也不满意，因为她的虚荣心强，嫉妒成性。
福临对董鄂妃（孝献皇后）情有独钟，但不幸的是，董鄂妃早逝，福临因此非常悲痛。
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