借款合同的印花税税率是 借款金额的万分之零点五（0.05‰）。根据最新的相关文件，无论是银行业金融机构还是经国务院银行业监督管理机构批准设立的其他金融机构与借款人签订的借款合同，均需要按照这个税率缴纳印花税。同时，需要注意的是，民间借贷合同不属于应税合同，因此不需要缴纳印花税。
计算应纳税额的方法很简单，只需将借款金额乘以税率即可。例如，如果借款金额为100万元，那么应纳税额就是100万元乘以0.05‰，等于50元。
建议在签订借款合同时，务必注意遵守相关印花税法规定，按时足额缴纳印花税，以避免不必要的法律风险。