港澳通行证补办流程如下：
立即报失
向居住地或户籍所在地的出入境管理部门进行挂失。
补办手续
在大陆地区：
准备材料：身份证、户口本原件及复印件，以及近期免冠彩色照片。
前往办理：携带上述材料，前往出入境管理部门或受理点填写申请表并提交。
支付费用：根据当地规定支付证件工本费。
领取证件：在回执上所示的领证日期或之后，凭身份证和回执领取新证。
在港澳地区：
提供报失证明：凭香港警方出具的证件遗失报警单或澳门治安警察局出具的报失通知书。
申请临时通行证：向香港或澳门中国旅行社申请一次性有效的《出入境通行证》（临时通行证）。
提交材料：填写出入境通行证申请表，提交身份证明文件及照片。
领取证件：按取证时间到指定地点领取临时通行证。
办理离境手续：领取临时通行证后，需亲自前往香港入境事务处办理离境手续。
请注意，补办流程可能因地区或具体情况有所不同，建议提前咨询当地出入境管理部门获取最新信息。