金刚狼的能力消失可以归因于以下几个主要原因：
细胞衰老：
金刚狼的细胞再生能力虽然强大，但并非无限制。随着时间的推移，细胞会逐渐失去再生能力，并启动细胞自杀程序，导致衰老现象。
艾德曼合金的影响：
金刚狼体内被注入艾德曼合金，这种金属对他的身体有侵蚀作用，长期下来可能导致中毒和窒息，影响他的自愈能力。
自愈因子的流失：
自愈能力虽能延缓衰老，但自愈因子会随时间流失，使得金刚狼的自愈能力逐渐减弱。
转基因食品的影响：
人类研发的转基因食品对变种人基因造成损害，金刚狼食用后也导致了自愈因子的丧失。
自然老化：
即使是拥有超强自愈能力的变种人，也逃不过自然老化过程，细胞再生能力最终会透支。
外部因素：
在《金刚狼3》的故事中，金刚狼还受到了世界政府中反变种人组织研发的转基因食品的影响，进一步削弱了他的能力。
身体损伤：
金刚狼在电影中遭受了无数伤害，这些身体损伤对他的自愈能力也是一种负担。
精神压力：
长期面对亲人和朋友的丧失，以及自身能力的不断减弱，给金刚狼带来了巨大的精神压力，这也可能间接影响了他的能力。
以上各点综合起来，导致了金刚狼的能力逐渐消失。在《金刚狼3：殊死一战》中，这些因素最终导致金刚狼的死亡