非法行医通常由卫生行政部门负责处理。根据《中华人民共和国刑法》和《医疗机构管理条例》，未取得《医疗机构执业许可证》擅自执业的行为，会受到以下处罚：
1. 卫生行政部门会责令停止非法执业活动，并可能没收非法所得和药品、器械。
2. 根据情节轻重，卫生行政部门可以对非法行医者处以1万元以下的罚款。
3. 如果非法行医行为构成犯罪，如严重损害就诊人身体健康或造成就诊人死亡，将面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并可能处以罚金。
在严重的情况下，非法行医案件可能会移交给公安机关进行刑事立案侦查。
如果您遇到非法行医的情况，可以向当地卫生局、卫生防疫站、工商局或派出所等部门举报