在深圳，驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的处罚如下：
记6分：
根据《道路交通安全违法行为记分分值》的规定，驾驶机动车违反道路交通信号灯通行的，一次记6分。
罚款200元：
根据《道路交通安全法》的规定，闯红灯可处200元罚款。
此外，对于多次闯红灯的处罚：
第二次闯红灯罚300元。
第三次罚款1000元。
5次以上，除罚款外，每次征收的临时悬挂机动车驾驶证3个月。
若在一个记分周期内被记满12分，除将被深圳交警扣留驾驶证外，还要到交警部门接受为期7天的交通安全教育，经考试合格后才能取回驾驶证。
建议：驾驶员应严格遵守交通规则，避免闯红灯等违法行为，以免给自己和他人带来不必要的麻烦和损失。