在秦朝时期，封君和侯的爵位体系是严格按照等级划分的，侯的地位通常高于君。侯爵是比君爵更高一级的爵位，通常侯的封地要比君的封地大得多，侯属于超级大封君，而君可能只是一个荣誉称号，不一定伴随实际的封地。例如，在战国时期，吕不韦被封为文信侯，食河南洛阳十万户，这是一个侯爵的例子，而秦国的其他封君可能封地较小。
需要注意的是，封君和侯的爵位体系在战国时期的秦国是特定的，而在其他诸侯国可能有所不同。例如，在战国前期，韩国、赵国、魏国等国的国君的爵位为侯爵，而秦国的国君在春秋战国时期并不一定是各个诸侯国中地位最高的，最大的是秦始皇嬴政，因为他统一了中国。
总结来说，在秦朝，侯的地位高于君。