马来西亚签证确实存在拒签的可能性。以下是一些可能导致拒签的因素：
黑名单问题：
如果之前入境过马来西亚有过逾期滞留或被列入黑名单（如BLI或RAI），申请签证时可能会被拒签。
材料问题：
提交的材料如果不够真实或存在弄虚作假，或者关键材料缺失，都可能导致拒签。
文件问题：
文件公证书字迹模糊，或者照片不符合要求（未使用近期高清照片、照片未漏出耳朵、姿势不端正、两次提交照片不一致）也可能导致拒签。
目的不明确：
如果无法明确表述出国目的，签证官可能会怀疑申请者可能从事与签证内容不一致的活动。
健康问题：
患有某些传染性疾病，如乙肝、艾滋等，是不允许留学的，这也会导致签证申请被拒绝。
尽管存在拒签风险，但正常情况下，只要申请者没有上述问题，并且材料齐全、真实，通过电子签证的申请还是相对容易的。建议在申请前仔细检查所有材料，并确保符合要求，以提高签证通过率。