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蛋白质数据库有哪些

原创2025-06-20 18:46:08

当前,有多个重要的蛋白质数据库,它们提供了关于蛋白质序列、功能、结构、相互作用和表达信息等方面的数据。以下是一些主要的蛋白质数据库:

UniProt (Universal Protein Resource)

网址:[https://www.uniprot.org/](https://www.uniprot.org/)

描述:由EBI、PIR和SIB合作建立,提供详细的蛋白质序列和功能信息,包括功能描述、结构域、转录后修饰、修饰位点、变异度、二级结构、三级结构等。

PDB (Protein Data Bank)

网址:[https://www.rcsb.org/](https://www.rcsb.org/)

描述:包含大量蛋白质、DNA和RNA结构数据,提供通过实验手段确定的三维结构数据。

Human Protein Atlas (HPA)

网址:[https://www.proteinatlas.org/](https://www.proteinatlas.org/)

描述:基于蛋白组学、转录组学以及系统生物学数据,提供人类编码蛋白的mRNA和蛋白质表达信息,用高分辨率免疫组化染色图显示。

InterPro

描述:集成的蛋白质结构域和功能位点数据库,提供关于蛋白质家族、域、重复序列和作用位点的数据资源。

BRENDA

描述:酶数据库,提供酶的分类、命名法、生化反应、专一性、结构、细胞定位、提取方法、文献、应用与改造及相关疾病的数据。

Binding DB

描述:提供蛋白质-配体相互作用数据。

String

描述:提供蛋白质相互作用网络信息。

GeneCards

描述:提供基因和蛋白质的综合信息。

Genatlas

描述:提供基因表达谱数据。

这些数据库在生命科学研究和药物开发中起着关键作用,提供了丰富的数据资源,便于科研人员查询和分析蛋白质相关信息。

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