办理食品加工厂需要准备以下证件：
营业执照：
这是合法经营的必要前提，需要到当地工商行政管理局办理。
食品生产许可证：
证明企业具有生产加工食品的能力和资格，需要到当地食药监局办理。
健康证：
所有直接接触食品的工作人员，如厨师、卫生清洁员等，必须每年进行健康检查并持有健康证。
食品流通许可证：
如果涉及食品销售，需要办理此证。
环保审批：
需要向当地环保部门申请，确保生产活动符合环保要求。
消防审批：
确保厂房和设备符合消防安全要求，需要提供相关的消防设施和材料。
税务登记证：
需要提供相关资料到当地税务机关办理。
ISO22000国际质量管理体系、国际食品安全体系认证：
根据食品安全法规定，食品加工企业可能需要获得认证。
办理流程通常包括：
填写相关申请表格。
准备必要的文件和证明材料，如厂房、设备、环境证明等。
提交申请至当地食品药品监督管理部门。
部门审核资料，可能进行现场核查。
审核通过后，颁发相应的证件。
请根据最新的法律法规和当地的具体要求准备相应的材料，并咨询当地相关部门获取详细信息。